Підготовку студентів здійснюють 5 кафедр:

• кафедра історії України,
• кафедра історії стародавнього світу і середніх віків,
• кафедра нової та новітньої історії,
• кафедра історії Східної Європи,
• кафедра історіографії, джерелознавства та археології.

Також підрозділами факультету є:

• Германо-слов’янська археологічна експедиція,
• Лабораторія історичної інформатики,
• Музей археології,
• Музей історії Харківського університету.