Підготовку студентів здійснюють 4 кафедри:

• кафедра історії України,
• кафедра історіографії, пам'яткознавства та археології,
• кафедра історії стародавнього світу та середніх віків,
• кафедра історії модерної доби та новітнього часу.

Також підрозділами факультету є:

• Германо-слов’янська археологічна експедиція,
• Лабораторія історичної інформатики,
• Музей археології,
• Музей історії Харківського університету.